Reportage : RV Sikuliaq

RV Sikuliaq
05 octobre 2018
RV Sikuliaq

© Elisabeth RULL / Divergence

Lors du workshop de microbiologie mené par la post-doctorante Anne-Lise Ducluzeau à bord du RV Sikuliaq, les étudiants ont à disposition 6 séquenceurs MinION et 6 ordinateurs portables fournis par le laboratoire du professeur Devin Drown dans lequel Anne Lise travaille. Après une présentation théorique du protocole d'extraction d'ADN et du séquenceur MinION , de la société Oxford Nanopore Technology, les étudiants se familiarisent avec le pipetage et le matériel de séquençage. Le MinION, un petit boitier gris, est disposé devant chaque ordinateur portable, il est chargé de la solution d'ADN environnemental à séquencer, obtenue à partir des prélèvements d'eau du CDT. Les données analysées permettent de dresser un profil des espèces et leur répartition dans les différentes strates d'eau aux différents points de prélèvement. Le séquenceur MinION peut aussi être associé au boitier d'analyse des données MinIT, encore prototype au moment du workshop et testé à cette occasion par Anne Lise uniquement. MinION, MinIT et smartphone suffisent alors pour créer un dispositif autonome de séquençage et d'analyse de résultats sur le terrain.

Lieu : Etats-Unis

Mots clés : navigation, recherche, mer, navire, étudiants, mer de Béring, alaska, bateau, science

ERU0007286